Akademia Morska w Szczecinie pozyskała 5 mln zł z Narodowego Centrum Badań i Rozwoju na unowocześnienie systemów zarządzania. Dzięki temu już w 2014 r. będzie jedną z najnowocześniej zarządzanych uczelni w Polsce.

W listopadzie 2011 r. NCBiR ogłosiło konkurs w ramach działania 4.1.1 Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki na rozwój uczelni. Do konkursu o 150 mln zł stanęło 206 uczelni z całej Polski. Do oceny merytorycznej dopuszczono 186 z nich. Konkurs rozstrzygnięto 8 maja 2012 r. Dofinansowanie otrzymały 33 szkoły wyższe w tym Akademia Morska w Szczecinie zajmując na liście rankingowej wysokie 3 miejsce w Polsce oraz pozyskując prawie 5 mln zł. Pozostałe uczelnie z województwa zachodniopomorskiego nie zdobyły dofinansowania. Dzięki środkom z Unii Europejskiej w Akademii wdrożony zostanie zintegrowany system informatyczny składający się z 10 modułów, które będą ze sobą ściśle współpracowały.